日前，卫生部部属（管）医院2010-2012年度临床重点学科项目公布结果开始进行到实施阶段，2010年10月卫生部组织医学科研领域专家对进入终审的119个项目进行最终评审。我校初审上报23项，经过初评及终审答辩，最终14项获得卫生部临床重点学科项目立项资助。每项卫生部资助200万元，医院1：1经费配套，项目执行期三年。
复旦大学附属中山医院汤钊猷院士带领的团队注重基础研究与临床医学的转化，重点关注在肝癌的转移、复发方面的研究，自1992年卫生部设立部属医院临床重点学科项目开始连续5次获得卫生部资助支持。这次是第6次获得卫生部支持，由樊嘉教授领衔。研究团队在十一五期间，共获国家科技进步奖一等奖1项、二等奖1项，国家自然科学二等奖1项，部市自然科学奖和科技进步一等奖3项，国家发明专利4项。发表论文120余篇，其中影响因子大于10有13篇（包括N Engl J Med, Cancer Cell，J Clin Oncol，Gastroenterolgy, Hepatology等）论文。并且建立了世界上独一无二的较为完善的人肝癌高转移模型系统。20余次国际学术会议特邀报告，包括Plenary, State-of-art Lecture等。
复旦大学附属华山医院顾玉东院士带领的华山医院手外科临床研究团队，紧紧围绕臂丛神经的相关临床问题展开研究，自1992年卫生部设立部属医院临床重点学科项目开始连续5次获得卫生部资助支持。本次亦为第6次连续获得资助。经卫生部5次临床重点项目的支持，华山医院顾玉东团队首创了膈神经移位、健侧颈7移位、同侧颈7移位、进胸长段膈神经移位、肌皮神经肱肌支移位术，已使患者肩肘功能达到基本恢复，腕、指的屈伸得到改善。总体研究水平已达国内领先，部分研究内容居国际先进。研究成果获得国家科技进步二等奖2项，国家技术发明二等奖1项，上海市科技进步二等奖1项等奖项。
卫生部部属（管）医院临床学科重点项目每3年为一个周期。自1992年设立以来，项目建设取得了一批重要临床医学研究成果，部分项目达到了国际先进水平，培养了一批拔尖人才，推广了一批临床适宜技术，促进了我国临床医学的发展。绝大多数研究成果在第一时间就应用于临床，在减轻病人痛苦、缩短治疗时间、减轻病人经济负担等方面发挥了重要作用。
我校获得卫生部资助的14项项目为：
